福州眼科医院最早由厦门大学附属厦门眼科中心与福州市第二医院联合创办，是一所集医疗、教学、科研为一体的三级眼科专科医院，开设有眼底病、眼外伤、眼表及角膜病、白内障、青光眼、屈光眼肌、眼眶及眼整形、小儿斜弱视等专科，以及临床医技检查、检验、医学验光配镜部等临床辅助科室。开展全飞秒激光近视手术、圆锥角膜交联术、23G/25G/27G玻璃体视网膜手术、折叠人工玻璃体球囊植入术、飞蚊症激光及27G玻璃体手术、显微镜下斜视微创手术、飞秒激光辅助超声乳化手术、散光矫正型人工晶体植入术、三焦点、无级变焦及区域折射等多焦点人工晶体植入术、有晶体眼人工晶体(ICL)植入术、1.8mm小切口白内障超声乳化术、CLASS手术、眼部肿瘤摘除术、新材料眼眶骨折复位手术等手术。

        福州眼科医院购置了一系列现代化眼科诊疗设备，如拥有德国蔡司VisuMax3.0全飞秒& MEL90准分子激光联机手术平台、三维眼前节分析仪Pentacam、角膜地形图/Zeiss/Atlas 9000(Mel90联机);美国爱尔康centurion白内障超乳机、美国博士伦VICTUS飞秒激光白内障手术系统、Verion手术导航系统、美国爱尔康infinitiozil超乳机、进口手术显微镜、Alocn玻切超乳一体机、美国Synerhetics吊顶灯、骨动力系统;眼前节照相系统、COS干眼分析仪、OPD角膜屈光分析仪、AB超及角膜测厚仪、OA2000光学生物测量仪、KOWA FM-600激光前房闪辉仪、超声生物显微镜UBM、电生理、视野计、德国OCT-4光学相关断层扫描仪，TOPCON血流OCT、Optos欧堡广角激光眼底扫描仪、海德堡眼底荧光造影、YAG激光仪、YAG激光飞蚊症治疗仪;医院的医疗设备等硬件水平已达到省内较高水平。